R 패키지 surveillance를 활용한 시공간 전염병 분석 가이드
본 논문은 R 오픈소스 패키지 **surveillance**가 제공하는 세 가지 시공간 전염병 모델(twinstim, twinSIR, hhh4)을 소개하고, 개별 사건 데이터, 이산 단위 사건 기록, 지역·시간별 집계 데이터에 대한 시각화·추정·시뮬레이션 절차를 상세히 설명한다. measles와 invasive meningococcal disease 사례를 통해 모델 구현과 결과 해석을 실증적으로 보여준다.
저자: Sebastian Meyer, Leonhard Held, Michael H"ohle
본 논문은 지리코드화된 보건 데이터와 전염병의 시간적 특성을 활용한 시공간 통계 모델링에 대한 필요성을 제기하고, 이를 지원하는 R 패키지 **surveillance**의 기능을 종합적으로 소개한다. 서론에서는 전염병 데이터가 실험 설계가 아닌 관찰 데이터이며, 사건 간 의존성 및 부분 관측성 때문에 전통적인 통계 방법으로는 분석이 어려움을 강조한다. 이어서 기존 R 패키지(e.g., EpiEstim, R0, outbreaker, tscount, etasFLP 등)와의 차별점을 설명하고, **surveillance**가 제공하는 세 가지 데이터 유형—연속공간·연속시간 개별 사건, 이산 단위 사건 이력, 지역·시간 집계 카운트—에 맞춘 전용 데이터 클래스와 모델을 제시한다.
첫 번째 모델 **twinstim**은 연속공간·연속시간에 발생한 개별 사건을 자기흥분 점 과정으로 모델링한다. 사건 강도 λ(s,t)는 외생 요인에 기반한 **endemic** 성분 ν
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