단백질 폴딩에서 일정한 m값과 변하는 비구조 상태 붕괴의 분자적 기원

초록

이 연구는 두 단계 폴딩 단백질에서 변성제 농도에 따라 자유 에너지 변화가 선형으로 나타나는 m값이 일정하게 유지되는 이유와, 낮은 변성제 농도에서 비구조 상태가 붕괴(컴팩트화)되는 현상을 분자 시뮬레이션으로 규명한다. 백본 표면적 변화가 m값을 주도하며, 고농도에서는 백본 표면적 분포가 좁아 m값이 일정하고, 저농도에서는 백본이 내부로 침투하면서 Rg가 감소하고 m값이 변한다. 또한 개별 잔기의 전이 중간점이 서로 다르게 나타나 전역적인 전이는 ‘전부 혹은 전무’ 형태라도 미세 수준에서는 비균일함을 보여준다.

상세 분석

본 논문은 전통적인 두 단계 폴딩 모델에서 관찰되는 m값의 상수성(m = dΔG_ND/d