확장 가능한 데이터프레임 시스템으로의 진전

읽는 시간: 5 분
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📝 원문 정보

  • Title: Towards Scalable Dataframe Systems
  • ArXiv ID: 2001.00888
  • 발행일: 2020-06-03
  • 저자: Devin Petersohn, Stephen Macke, Doris Xin, William Ma, Doris Lee, Xiangxi Mo, Joseph E. Gonzalez, Joseph M. Hellerstein, Anthony D. Joseph, Aditya Parameswaran

📝 초록 (Abstract)

데이터프레임은 데이터를 표현하고 준비하며 분석하는 데 널리 사용되는 추상화 수단이다. 그러나 Rand와 Python의 데이터프레임 라이브러리는 상당한 성공을 거두고 있지만, 비교적 큰 규모의 데이터셋에서도 성능 문제에 직면한다. 또한 데이터프레임의 의미론에 대한 혼란도 존재한다. 본 논문에서는 확장 가능한 데이터프레임 시스템을 위한 비전과 로드맵을 제시한다. 이 분야의 잠재력을 보여드리기 위해, 오늘날 가장 널리 사용되고 복잡한 데이터프레임 API인 Python의 pandas를 기반으로 한 확장된 구현체 MODIN을 개발한 경험에 대해 보고한다. pandas를 참조로 하여, 논의의 근간이 되는 간단한 데이터 모델과 대수를 제안한다. 이 기초 위에서, 데이터프레임의 독특한 특징들 때문에 데이터 관리의 여러 차원에서 최신 수준을 확장해야 할 개방된 연구 기회들의 아젠다를 제시한다. 유연한 스키마, 정렬, 행/열 동등성, 데이터/메타데이터 유동성 등 데이터프레임의 특징적인 요소들과 데이터프레임과 상호작용하기 위한 조각별, 시도착오 기반 접근법에 대한 함의를 논한다.

💡 논문 핵심 해설 (Deep Analysis)

This paper presents a vision and roadmap for scalable dataframe systems, focusing on overcoming performance issues and semantic ambiguities in existing dataframe libraries. It introduces MODIN, an expanded implementation of Python's pandas API, to demonstrate the potential for improved scalability and performance. The authors propose new data models and algebraic operations to address the challenges faced by current dataframe systems, particularly those related to handling large datasets and complex data structures.

Key Summary: This paper aims to enhance scalable dataframe systems through a comprehensive roadmap and introduces MODIN as an example of how such improvements can be achieved.

Problem Statement: The authors highlight that despite successful dataframe libraries in R and Python, these systems often face performance issues with moderate-sized datasets. They also identify semantic ambiguities within dataframes that need addressing for more efficient data management.

Solution Approach (Core Technology): MODIN is introduced as a scaled-up version of pandas, utilizing parallelization techniques like row-based, column-based, and block-based partitioning to improve processing efficiency. It leverages virtual columns to avoid materializing data until necessary, thereby optimizing memory usage and computational load.

Key Results: The authors report significant performance improvements with MODIN compared to traditional pandas, particularly in tasks such as group-by operations and transposing large datasets. These enhancements demonstrate the feasibility of scaling dataframe systems for larger datasets.

Significance and Utilization: This research is crucial for advancing data management practices by providing a scalable framework that can handle complex data structures efficiently. It supports both researchers and developers in optimizing their data processing workflows, especially with large-scale datasets.

📄 논문 본문 발췌 (Translation)

# 소개

비즈니스적 성공에도 불구하고 관계형 데이터베이스는 “빠르고 허술한” 탐색적 데이터 분석(EDA)에 있어서 눈에 띄는 제약을 가지고 있습니다. 데이터가 검토되기 전에 스키마를 먼저 정의해야 하며, 잘 구조화되지 않은 데이터는 쿼리하기 어렵고, 스키마에 대한 깊은 이해 없이는 복잡한 분석이 어려울 수 있습니다. SQL의 선언적 특성은 모듈식 개발 방법과 상충될 수 있으므로 프로그래밍 언어인 Python 및 R에서는 이러한 문제를 해결하기 위해 데이터프레임 추상화가 지원됩니다. 데이터프레임은 알려지지 않은 데이터 구조에 대해 더 관용적이며, 개발자와 데이터 과학자의 워크플로우에 적합한 함수형 인터페이스를 제공합니다.

데이터프레임에는 다음과 같은 특징들이 있어 EDA에서 매력적인 선택이 됩니다:

  • 행과 열 모두에 대한 암시적 순서를 포함하고 그들을 대칭적으로 취급하는 직관적인 데이터 모델;
  • 관계형(예: 필터, 조인), 선형대수학(예: 전치), 스프레드시트와 같은 다양한 분석 모달리티를 연결하는 쿼리 언어;
  • 간단한 표현식의 쉽게 그리고 신속하게 검증하고 복잡한 쿼리를 반복적으로 정제 및 조합할 수 있는 증분적 구성 가능한 쿼리 구문;
  • 파이썬과 같은 호스트 언어에 내장되어 있으며 명령형 세마틱을 갖추고 있습니다.

이러한 특징들로 인해 데이터프레임은 EDA에서 매우 인기가 있었습니다. 예를 들어, Python의 pandas (pandas.pydata.org)는 2020년까지 3억 회 이상 다운로드되었으며 GitHub에 있는 22만 개 이상의 저장소에서 의존하고 있으며 25,000회 이상 스타를 받았습니다. 파이썬 자체의 인기도 pandas를 통한 데이터 탐색 및 데이터 과학 성공과 연결되어 있습니다.

pandas는 즉각적인 또는 임시적인 필요를 충족하기 위해 만들어졌으며 관계 대수, 선형대수, 스프레드시트 계산을 모방하는 능력을 갖추고 있습니다. 현재까지 DataFrame API는 200개 이상의 연산자로 팽창되었습니다. R은 pandas보다 더 성숙하고 신중하게 관리되고 있지만 여전히 70개의 연산자를 가지고 있으며, 이는 관계형과 선형대수를 합친 것에 비해 훨씬 많습니다.

이렇게 다양한 API는 때때로 pandas의 매력적인 이유로 언급됩니다. 그러나 이러한 연산자 집합에는 성능을 다르게 의미하는 중복이 많이 포함되어 있습니다. 이러한 중복은 사용자가 목표를 표현하기 위한 최적 방법을 선택하는 데 상당한 부담을 가집니다.

방법론

데이터프레임은 기능성을 결합하여 관계 대수 및 선형대수의 성과를 활용하고, 그것들을 결합하고 확장할 수 있는 가능성이 있습니다. 지난 20년 동안 데이터베이스 커뮤니티는 다양한 방향으로 테이블 저장을 탐색해 왔습니다. 이 작업에서 기본 개념인 데이터 독립성은 미래의 데이터프레임 시스템에 중요한 역할을 할 수 있습니다.

오늘날의 데이터프레임 시스템은 여러 파생 데이터프레임 간에 공통 물리적 저장 공간을 사용하여 메모리 요구사항을 줄입니다. 그러나 향후 데이터프레임 기술은 계산을 저장에 대신하는 뷰 기반 표현 방식을 탐색할 수 있습니다. 예를 들어 Vaex 프로젝트는 HDF5 파일에서 쿼리를 수행하는 데이터프레임과 유사한 시스템으로, 가상 열을 구현합니다.

초기 사례 연구

우리는 EC2 x1.32xlarge 노드(128개의 코어와 1,952GB 메모리)를 사용하여 New York City 택시 데이터셋을 이용해 MODIN의 성능을 평가했습니다. 이 데이터셋은 1부터 11까지 복제되어 20GB에서 250GB 사이의 데이터셋 크기와 최대 16억 개의 행을 제공합니다. 다음 쿼리를 고려하고 있습니다:

  • map: 각 값이 null인지 확인하고, 그렇다면 대체하고 그렇지 않으면 원래 값을 유지.
  • groupby ($`n`$): “passenger_count” 열의 비-NULL 값에 대해 그룹화하고 각 그룹의 행 수를 세는 것.
  • groupby ($`1`$): 데이터프레임에서 비-NULL 행의 수를 세는 것.
  • transpose: 데이터프레임의 열과 행을 교환한 후 새 행에 간단한 (map) 함수를 적용하는 것.

그림 [[IMG_PROTECT_0]]은 group by ($`n`$) 및 group by ($`1`$) 연산에서 MODIN이 각각 pandas보다 최대 19배와 30배의 속도 향상을 보여주는 것을 나타냅니다. 예를 들어, 250GB 데이터프레임에 대한 group by ($`n`$)은 약 359초가 걸리지만 MODIN은 18.5초만에 수행합니다.

Reference

이 글은 ArXiv의 공개 자료를 바탕으로 AI가 자동 번역 및 요약한 내용입니다. 저작권은 원저자에게 있으며, 인류 지식 발전에 기여한 연구자분들께 감사드립니다.

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