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1. 연구 배경 및 목적 마이크로컴파트먼트(MCP) 는 독성 중간체(프로피오날데히드)를 격리하고 대사 흐름을 효율화하기 위해 진화한 세균 구조물이다. 기존 in vitro 실험(정제된 MCP)에서는 1,2‑PD가 1 h 내에 거의 완전히 소모되는 반면, in vivo 에서는 18 h에 걸쳐 서서히 소모된다. 이러한 차이는 대사 흐름 모델링 을 통해 정량적으로 설명하고, MCP 내부·외부 효소 배분을 재정의하고자 하는 것이 본 연구의 핵심 목표이다. 2. 모델링 접근법 | 요소 | in vitro 모델 | in vivo 모델 (본 연
| 구분 | 내용 | 평가·의의 | | | | | | 연구 배경 | GRN의 피드백‑진동은 생체시계·p53‑Mdm2 등 핵심 현상.<br> 저분자 수 환경에서 내재적 잡음은 필연적. | 잡음‑진동 상호작용을 정량화하려는 필요성은 충분히 설득력 있다. | | 방법론 | 1. 두 번째 모멘트 접근 (second‑moment) → ODE 형태로 변환.<br>2. 선형화 + 전이함수 이용해 고차원 고유값 문제 회피.<br>3. 그래픽 안정성 기준 (Nyquist‑like) 적용. | 기존 CME → 직접 해석이 어려운 점을 우회함.<br>
1. 연구 배경 및 문제 정의 표현형 정의의 모호성 : 전통적으로 표형은 소수의 바이오마커 값으로 정의되지만, 이는 동일한 마커 조합을 가진 서로 다른 세포 상태를 구분하지 못한다. 반대로 전사·단백질·대사 전산 분석은 과다한 정보를 제공해 핵심 마커를 추출하기 어렵다. 네트워크 모듈 vs. 동적 모듈 : KEGG·Reactome 등에서 제공하는 경로는 정적 그래프이며, 기능적 모듈을 구조만으로는 식별하기 힘들다. 동적 모델링을 통해서만 실제 기능적 모듈을 파악할 수 있다는 점을 강조한다. 2. 핵심 개념 및 정의 | 개념 | 설명
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